에디우스를 사용하시면 됩니다

1. MXF는 컨테이너일 뿐입니다.
지금 겪고 계신 상황에서 알아봤자 도움 안되는 정보죠.
지금 필요한건 코덱이 뭔지, 해당 카메라가 릴네임메타데이터를 지원하는 기종인지, 데이터는 이런거 감안해서 정리가 되어있는지 여부입니다.

2. 프록시 생성 에서 제일 중요한건 릴네임 유지입니다.
카메라에서 메타데이터로 릴네임을 지원한다면 메타데이터 기반으로, 없어서 강제지정해야 한다면 그걸 준비할 수 있게 파일네임관리가 되어있는지 확인하고 안되어있다면 정리한 다음에 파일네임을 기준으로 릴네임을 부여해 줘야 합니다.
이런 정보가 따로 없는 상태라면, 기본적으로 프리미어에서 프록시를 내리면 안되고, 다빈치도 세부세팅을 잘 해줘야 합니다.

이런거 모르고 프리미어에서 해도 아무 문제 없다고 하는사람도 많겠지만...
그건 운이 좋았거나, 다른 파트에서 대신 메꿔줬거나, 문제가 생기지 않을정도로 소규모 작업이었거나여서입니다.
프록시 생성을 외주를 맡길 정도인데 위에 이야기한 원칙이 지켜지지 않은 프록시를 만들어 주면 물론 운이 좋으면 대충 넘어갈 수도 있겠지만, 재수없으면 작업비를 받기는 커녕, 나중에 손해배상청구를 받아도 이상할게 없는 상황입니다.

그러니 질문내용 해결 이전에 이것부터 해결하는게 좋습니다.

다빈치 유료버전을 사용하면 해결될겁니다만...
위에 이야기한 내용이 해결안되면 안하느니만 못합니다.